6月30日，李登辉遭指控在国安密账中涉嫌挪用和侵占公款，特侦组侦结，依贪污治罪条例将他正式起诉。在此刻台湾的政治气氛中，陈水扁已入狱，李登辉又遭起诉，无疑是一爆炸性话题，对正展开中的“大选”会产生什么样的冲击，无疑令人关注。
李登辉的“国安密账案”早已不是新闻，陈水扁在2008年提出此一指控，即有人认为指证历历，但也有人认为，阿扁牵拖老李，皆为自保。李登辉办公室当时强调此一指控空穴来风，但特侦组的调查也不可能无中生有。现在正式成为一个司法案件，法院的审理将澄清出更多真相，纯粹于司法面而言，此刻不但尚无定论，但其引发的岛内政治效应恐将持续影响。
“国安密账”，既日“密账”，可想而知，其中有很多难以公开的秘密。但此一预算项目不但金额惊人，且性质特殊，与各种特别费案的“历史共业”，或陈水扁在国务机要费案中自辩的“大水库理论”皆不相同，故有待法院审理抽丝剥茧。如今情况较为特殊的，不但是李登辉本人的身份，并且国民党立委邱毅曾指控蔡英文在“国安密账案”中扮演特定角色，甚至宣称握有蔡英文领钱的证据，则司法案件于此刻展开，恐将引发新一轮蓝绿博弈。司法案件一旦被质疑为具政治色彩，不管证据如何说话，还是会在社会观感上沦落到“信者恒信，不信者恒不信”的地步，在选战气氛中尤其会激化蓝绿对立。这是最令人担忧之处。
李登辉案现在正式进入司法阶段，整个审理过程，恐怕都会让蔡英文笼罩于也涉入“国安密账案”的疑云下，成为“大选”摆脱不掉的话题，对蓝绿各自的支持者也会产生迥然相反的印象和感受。司法案件却免不了这样的政治效应，确实值得留意其影响力。